2019年，湘雅三医院实际到账总科研经费较2018年增长25.4%，首次突破亿元大关，达1.02亿元，创历史新高。
2019年，在医院第四次党代会提出的“一体三翼”发展新格局下，湘雅三医院科研工作实现了跨越式发展，作为医院行稳致远的侧翼，为新湘雅卓越发展新航程提供了上升的动力。
2019年，湘雅三医院在复旦版中国医院排行榜科研学术排行榜中名列第62名，在Nature指数大学/机构学术排名中位居国内医疗机构第29位，FA（论文数量）/AC（分摊计数）比值排名第34位，在全球医疗机构科研实力排行榜500强中位居第198位。
全院科技工作者2019年发表SCI论文347篇，较2018年增长42%，其中袁洪教授团队在British Medical Journal（IF=27.604）、吕奔教授团队在Immunity（IF=21.522）上发表最新研究成果，邓昊教授团队1篇论文进入ESI高被引论文0.1%，实现零的突破。获得专利74件，其中发明专利 12项。“520受试者招募及试验信息交互平台系统V1.0”、“海贽宝宝护理油项目”成功转化上市。医院成功获批湖南省修复与再生安全性研究院士工作站、湖南省手术机器人重点实验室、湖南省血液病医学研究中心、湖南省心血管疾病临床医学研究中心，年度获批平台数创历史新高。
在抗击新冠肺炎疫情期间，医院也始终把疫情防控科研攻关作为一项重大紧急任务，充分发挥医工结合优势，运用互联网+、人工智能及云计算等现代化手段，先后与国防科技大学、知名药企集智攻关。日前，医院已与湖南华腾制药有限公司达成合作协议，开展抗新型冠状病毒药物及防疫制剂研究；与国防科技大学协同研究的“新冠病毒传播预测和防控措施评估系统”已研制成功，进一步为重点区域疫情防控“科学防治、精准施策”提供科技支撑；与湖南省杜士高电子科技发展有限公司携手研发“医用双效消毒灭菌柜”，首批生产的12台已分别捐赠给武汉及长沙公共卫生救治中心，为前线医护提供后方科技支持与服务。
同时，湘雅三医院抢抓“双一流”建设的重大历史机遇，深入贯彻实施“一流学科建设带动一流大学建设”战略，强优势、补短板，紧紧围绕“人才强院”战略，坚持目标导向，实施各类人才计划，建立以“优秀学科带头人、优秀团队、特色学科引领为导向的人才“引、用、育”的机制，2019年30余人入选湖南省“芙蓉学者”奖励计划、湖南省“225”人才工程、“湖湘青年英才”支持计划等省级人才项目。为提升学科建设和科研创新能力、增加高水平科研成果产出提供人才资源保障，促进了医院科研体量和质量水平的跨越式发展。
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